申时行知道这个时候是需要自己提高挈领、大胆把治国之道的革新再向前迈一步的时候，不然眼下的新政就会进行不下去就会失败，也就在这时站出来说了起来，然后就对朱翊钧道：
“陛下，臣请陛下下旨废朱学之官学，复古之儒学正统，并尊宋以来各派儒学，且明年开始取士文章不再完全依程朱之论！准天下士子采各家之观点，结合实际以论之！”
申时行的话亦如一记焦雷，炸裂在集合了帝王公卿的小小屋子内，让陈经邦等公卿皆一时颇为惊骇。
接着，申时行又阐述说：“程朱要求人人为圣，尽灭人欲，此本就不切实际，且与大仁大德相悖！若人人须为圣，则本就是要求人人为奴！”
“当然，若有人自甘为奴，乃至为天下之仆，而得圣贤之名，亦是可以的，也是利于社稷长治久安的，所以也不必废之，只是不独尊；新礼以汉人为本，自不在于要求汉人必须怎么做，而是允其有何权利！首先便是君父当有何权利，是需要明确的！”
“就如现在遇到的，君父能不能随意支配自己的内帑，难道不该明确吗？”
朱翊钧则看向海瑞：“海卿，你以为如何？”
海瑞道：“请陛下准臣缄默，不对此评议。”
“也行。”
朱翊钧点头。
这时，申时行则道：“陛下，臣认为大司农当同意，因为大司农本为理学最虔诚的弟子，却反而不能中进士，这说明以往科举虽然录的是以程朱理学为圭臬的士子，但在实际考试时又没有录取大司农这种真正践行理学之道而为圣人的君子，反而录取的是表面上要尽灭人欲崇尚道德，实际上文章行间不以程朱理学为念只会寻章摘句曲解程朱的伪君子。”
“卿所言有理，为多一些海卿这样的忠臣，少一些周弘论这样的虚伪腐儒，准卿所奏！”
“以此下诏，明年大比皆不再以程朱理学为纲，允士子自由阐发治国之论。”
“若考官以非程朱之论罢黜之，则治考官抗旨之罪！”
朱翊钧说后就道：“至于周弘论，把他直接押赴刑场处以斩立决！朕无意与之多言，欺朕者，自当杀之！”
“是！”
很快，周弘论就被从顺天府衙门拖了出来。
而在当天，周弘论之子周培乘则在知道此消息，而敲了登闻鼓，喊道：“家父进言获罪，即将问斩，然请陛下降慈恩，准学生代父受死！”
朱翊钧很快知道了这一情况，然后呵呵冷笑：“代父受死？他只知道为父求情代死，不知道为朕这个君父不平，敢情他眼里只有孝没有忠？这样的不忠之辈，一并处死！”